整个故事的核心是神秘发明家与苏联的合谋，他们计划发动一场核战争，从而毁灭西方世界。玩家所属的特种部队被派遣前往阿拉斯加，执行任务摧毁苏联基地。在执行任务过程中，玩家逐渐揭开了“诺瓦”的身份，并了解到他的阴谋。通过故事解析，“诺瓦”所代表的神秘发明家的阴谋旨在利用科技力量破坏世界秩序，玩家所属的特种部队的任务是阻止他们的计划并保护全球的和平安定。
使命召唤黑色行动3的战役模式剧情围绕着神秘发明家主谋的阴谋展开。故事发生在冷战末期，玩家扮演一名精英特种部队士兵，被派往世界各地执行任务。
整个故事的核心是神秘发明家与苏联的合谋，他们计划发动一场核战争，从而毁灭西方世界。神秘发明家自称作为“诺瓦”，他拥有非常先进的技术，包括一种被称为“电磁脉冲”的武器，这种武器可以瘫痪现代科技。
剧情开始时，苏联已经占领了美国的阿拉斯加半岛，并且成功地在那里建造了一座基地。玩家所属的特种部队被派遣前往阿拉斯加，执行任务摧毁苏联基地。在执行任务过程中，玩家逐渐揭开了“诺瓦”的身份，并了解到他的阴谋。
通过展开研究，玩家发现“诺瓦”既不是美国人也不是苏联人，实际上，他是一位德国科学家，曾在二战期间为纳粹德国研究武器技术，而后躲入地下隐藏。他将自己的技术应用到了苏联的军事装备中，以实现自己国家复兴的目标。
玩家最终发现，“诺瓦”的最终目标是发动一场核战争，以便地下组织可以控制世界局势，并实现德国的崛起。玩家与特种部队一起展开行动，最终成功摧毁了“诺瓦”的基地，并阻止了核战争的爆发。
整个剧情模式充满了紧张刺激的战斗场景、高科技武器和情节的转折。通过故事解析，“诺瓦”所代表的神秘发明家的阴谋旨在利用科技力量破坏世界秩序，玩家所属的特种部队的任务是阻止他们的计划并保护全球的和平安定。